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Beacon Designer 8(設計引物軟件) V8.14 免費版

Beacon Designer 8(設計引物軟件) V8.14 免費版

  • 軟件授權: 免費軟件
  • 軟件類型: 國產(chǎn)軟件
  • 軟件語言: 簡體中文
  • 更新時間: 2021-12-09
  • 軟件評分:
  • 軟件大?。? 56.35M
  • 應用平臺:
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軟件介紹 下載地址

為您推薦:- 設計工具 設計引物軟件

基本簡介

  Beacon Designer是一款功能強大的引物設計軟件,能夠幫助用戶輕松建立核苷酸分析、NDA分析等項目,為用戶的引物分析工作提供了幫助。因為軟件為試用有時間時間限制,所以小編為大家找來了軟件的破解版,安裝完成即為正式版。

Beacon Designer

【軟件特點】

  1、FRET探針

  FRET探針-設計出不含二聚體,重復序列和運行序列的最佳FRET探針,以確保信號保真度。

  多重FRET探針和引物-檢查FRET探針是否與所有引物交叉雜交,以防止多重反應競爭。

  評估預先設計的FRET探針和引物-允許使用SYBR®green引物設計最佳的FRET探針。

  算法-使用高度精確的SantaLucia最近鄰居計算Tm熱力學值。

  圖形視圖-顯示探針二級結構的圖形視圖。

  2、Scorpions®底漆設計

  Scorpions®Primer-設計最佳的標準引物,Scorpions®引物,Probe和Scorpions®,不含二聚體,重復序列和運行序列,可確保信號保真度。

  等位基因識別-設計Scorpions®來檢測野生和突變等位基因。

  MultiplexScorpions®和引物-檢查Scorpions®是否具有交叉同源性,所有引物可防止多重反應競爭。

  預先設計的Scorpions®引物-允許使用預先設計的探針/引物來設計最佳引物/探針和蝎子。

  Tm計算-高精度發(fā)夾Tm計算。

  圖形視圖-顯示設計的Scorpions®Primer的圖形視圖。

  3、底漆設計

  設計引物-設計針對SYBR®Green / Beacon /TaqMan®/ FRET /Scorpions®/ HRMA應用優(yōu)化的引物對。

  算法-使用高度精確的SantaLucia最近鄰居熱力學值計算引物Tm。

  引物等級-根據(jù)引物效率對引物進行排名。根據(jù)引物的熱力學性質(zhì)和二級結構篩選綜合標準引物。

  自動引物多路復用-檢查引物池中的同源性,以減少引物二聚體。

  預先設計的引物-允許將先前設計的引物用于信標,TaqMan®,F(xiàn)RET,HRMA和SYBR®Green分析。

  避免模板的二級結構-設計引物時自動避免模板中的二級結構。

  避免交叉同源性-通過自動避免使用BLAST發(fā)現(xiàn)的同源性來確保信號保真度。

  引物擴增子和探針BLAST搜索-BLAST搜索引物,擴增子和探針以驗證設計的特異性。

  SNP擴增用于信標,TaqMan®,F(xiàn)RET和HRMA化學試劑的引物旨在擴增SNP。 SYBR®Green引物的設計應使區(qū)分等位基因的核苷酸位于其中一種引物的3'末端堿基處??梢詫RMA分析設計為擴增SNP和所有其他類型的突變,例如取代,缺失,插入等。

  一致的條件-運行中的所有引物均針對相同的PCR反應條件進行了優(yōu)化。

  4、爆炸搜索

  選擇性cDNA擴增-通過設計跨外顯子/外顯子和外顯子-內(nèi)含子邊界的引物來避免gDNA污染。外顯子區(qū)域通過解釋GenBank標頭注釋來識別。也可以手動指定它們。

  BLAST搜索-BLAST搜索整個序列,設計引物和擴增子以顯現(xiàn)特異性。

  BLAST數(shù)據(jù)庫-使用獨立的BLAST搜索本地自定義數(shù)據(jù)庫,或直接連接到NCBI服務器以獲取公共數(shù)據(jù)庫。

  重復和低復雜度區(qū)域-優(yōu)化BLAST搜索參數(shù)以在搜索NCBI可用的基因組數(shù)據(jù)庫時檢測重復和低復雜度區(qū)域。

  BLAST結果視圖-提供在序列,引物對,擴增子和探針上搜索BLAST的結果視圖。

  5、數(shù)據(jù)庫和數(shù)據(jù)管理

  設計模式-Beacon和TaqMan®設計位于不同的模塊中:允許在運行時進行模式切換。

  項目-創(chuàng)建多個項目。通過為每個實驗創(chuàng)建單獨的項目,可以輕松管理多個實驗的數(shù)據(jù)。

  應用程序數(shù)據(jù)庫-維護用于序列信息和搜索結果的本地數(shù)據(jù)庫。

Beacon Designer

【破解教程】

  軟件內(nèi)置了破解補丁,安裝完成將“patcher”文件中的所有文件復制到軟件的安裝目錄下即可自動注冊成為正式版。